Ja, in Kyoto gibt es viele Sehenswürdigkeiten - Goldener Tempel, etc. Die sind auch sehr schön, und man sollte sie sicher mal gesehen haben. Aber Kyoto ist auch eine Millionenstadt. Schau es Dir vielleicht vorher mal auf Google Maps an. Ich habe mehr als einmal Reisende getroffen, die sehr enttäuscht waren, weil Kyoto eben nicht zu 90% aus alten Gebäuden besteht, sondern vielleicht zu 20%. (Umgekehrt sind Japaner oft von Paris enttäuscht). Ich persönlich mag Kyoto sehr gerne, aber ich war auch schon ein paarmal da, und weiß eben, worauf ich mich einlasse.
Wie überlaufen es direkt vor der Kirschblüte ist, weiß ich nicht.
Alte Bauwerke und Tempel gibt es auch in der Umgebung von Kyoto - Nara z.B. ist m.W. nicht so überlaufen. Und auch andere Ecken von Japan haben alte Bauwerke.
Mt. Koya ist interessant, hat alte Tempel und Natur, und ist m.W. nicht so überlaufen, aber touristisch erschlossen. Kann ich empfehlen.